奥村 久士
| 領域 | 物理科学領域 |
|---|---|
| コース | 分子科学コース |
| 基盤機関 | 分子科学研究所 |
| 学位 | 博士(理学), 慶應義塾大学 |
| 職位 | 准教授 |
| キーワード | 分子動力学、タンパク質、アミロイド線維 |
| 外部リンク | https://researchmap.jp/read0102273/ https://nrid.nii.ac.jp/ja/nrid/1000080360337/ |
researchmap
キーワード
統計力学,熱力学
論文一覧(最新5件)
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- Cell position-based evaluation of mechanical features of cells in multicellular systems
- DOI: 10.1016/j.jtbi.2025.112070
- 出版社: Elsevier BV
- 出版年: 2025
- ジャーナル名: Journal of Theoretical Biology
- URL: https://researchmap.jp/read0102273/published_papers/52392612
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- Why Is Arginine the Only Amino Acid That Inhibits Polyglutamine Monomers from Taking on Toxic Conformations?
- DOI: 10.1021/acschemneuro.4c00276
- 出版社: American Chemical Society (ACS)
- 出版年: 2024
- ジャーナル名: ACS Chemical Neuroscience
- URL: https://researchmap.jp/read0102273/published_papers/52615828
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- Single-Molecule Kinetic Observation of Antibody Interactions with Growing Amyloid β Fibrils
- DOI: 10.1021/jacs.4c08841
- 出版年: 2024
- ジャーナル名: Journal of the american chemical society
- URL: https://researchmap.jp/read0102273/published_papers/48481350
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- Inhibition of amyloid-β(16–22) aggregation by polyphenols using replica permutation with solute tempering molecular dynamics simulation
- DOI: 10.2142/biophysico.bppb-v20.0045
- 出版社: Biophysical Society of Japan
- 出版年: 2023
- ジャーナル名: Biophysics and Physicobiology
- URL: https://researchmap.jp/read0102273/published_papers/47715175
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- Theoretical Analysis of the Aggregation-Inhibition Effect of Arginine on Polyglutamine Protein by the Generalized-Ensemble Method
- DOI: 10.2477/jccj.2023-0020
- 出版社: Society of Computer Chemistry Japan
- 出版年: 2023
- ジャーナル名: Journal of Computer Chemistry, Japan
- URL: https://researchmap.jp/read0102273/published_papers/52615769
KAKEN(研究代表者)
研究課題一覧(最新5件)
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- 脂質膜上の流れによるペプチドの凝集促進機構を分子動力学シミュレーションで解明する
- 2024-2026
- キーワード: 分子動力学シミュレーション, タンパク質凝集体, 流れ, アミロイドβペプチド
- URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24K09409
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- レーザー照射によるアミロイド線維の破壊機構を分子動力学シミュレーションで解明する
- 2021-2023
- キーワード: 分子動力学シミュレーション, アミロイド線維, 赤外線レーザー, アミロイドβペプチド, ポリアラニン, 水
- URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06118
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- アミロイド線維の動的秩序形成過程の全貌の理論的解明
- 2016-2017
- キーワード: アミロイド線維, 分子動力学, 界面
- URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-16H00790
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- 親水性/疎水性溶液界面でのアミロイドベータペプチド凝集機構の理論的研究
- 2014-2015
- キーワード: 分子動力学, アミロイド, 界面, アミロイド線維
- URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-26102550
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- 新しい分子動力学シミュレーション手法の開発とタンパク質折りたたみ問題への応用
- 2011-2014
- キーワード: 分子動力学, タンパク質, ペプチド, 分子動力学法, シミュレーション
- URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23740325
CiNii Articles(最新5件)
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- Implementations of replica-permutation and replica sub-permutation methods into LAMMPS
- 著者: Masataka Yamauchi, Giovanni La Penna, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura
- 出版日: 22-Jul
- 出版社: Elsevier BV
- ジャーナル名: Computer Physics Communications
- URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1360298761269298432
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- Dynamic properties of SARS-CoV and SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerases studied by molecular dynamics simulations
- 著者: Satoru G. Itoh, Shoichi Tanimoto, Hisashi Okumura
- 出版日: 21-Sep
- 出版社: Elsevier BV
- ジャーナル名: Chemical Physics Letters
- URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1360013168883998208
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- Dissociation process of polyalanine aggregates by free electron laser irradiation
- 著者: Okumura, Hisashi, Itoh, Satoru G., Zen, Heishun, Nakamura, Kazuhiro
- 出版日: 2023
- 出版社: Public Library of Science (PLoS)
- ジャーナル名: PLOS ONE
- キーワード: Amyloid proteins, Free electron lasers, Molecular dynamics, Hydrogen bonding, Lasers, Electric field, Biochemical simulations, Alanine
- URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1050586499779135616
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- 超音波と赤外線レーザーによるアミロイド線維の破壊を分子動力学シミュレーションで見る
- 著者: 奥村 久士
- 出版日: 2023
- ジャーナル名: 高圧力の科学と技術
- URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1010584168869343363
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- 赤外自由電子レーザによるアミロイド線維破壊の分子動力学シミュレーション
- 著者: 奥村 久士
- 出版日: 2022
- 出版社: 一般社団法人 レーザ加工学会
- ジャーナル名: レーザ加工学会誌
- キーワード: molecular dynamics simulation, amyloid-β peptide, amyloid fibril, Alzheimer’s disease, water, hydrogen bond, infrared laser
- URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1390024556298554368