大貫 隼

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キーワード

蛋白質,分子動力学シミュレーション,生体分子間相互作用,分子モーター,分子機械,アロステリー

論文一覧（最新5件）

• • Conformational Dynamics of Na+-Pumping NADH-Quinone Oxidoreductase during Na+ Translocation from AlphaFold-Facilitated Markov State Modeling
  • DOI: 10.1021/acs.jcim.6c00347
  • 出版年: 2026
  • ジャーナル名: Journal of Chemical Information and Modeling
  • URL: https://researchmap.jp/7000017497/published_papers/52142204
• • Enhanced sampling of protein conformations in AlphaFold3 with repulsive bias in the diffusion generative model
  • DOI: 10.64898/2025.12.17.693105
  • 出版年: 2025
  • URL: https://researchmap.jp/7000017497/published_papers/51931896
• • Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics for Efficient Conformational Sampling of Transporter Protein NarK
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.4c02726
  • 出版年: 2024
  • ジャーナル名: Journal of Physical Chemistry B
  • URL: https://researchmap.jp/7000017497/published_papers/48371477
• • Erratum: “Effects of Solvent Density Distribution and Dipole–Dipole Interaction on a Polarization Fluctuation near an Electrically Neutral Surface” [J. Phys. Soc. Jpn. 91, 114602 (2022)]
  • DOI: 10.7566/jpsj.92.078001
  • 出版社: Physical Society of Japan
  • 出版年: 2023
  • ジャーナル名: Journal of the Physical Society of Japan
  • URL: https://researchmap.jp/7000017497/published_papers/48173608
• • Accelerated Molecular Dynamics and AlphaFold Uncover a Missing Conformational State of Transporter Protein OxlT
  • DOI: 10.1101/2023.10.26.564285
  • 出版年: 2023
  • ジャーナル名: Journal of Physical Chemistry Letters
  • URL: https://researchmap.jp/7000017497/published_papers/45587912

KAKEN（研究代表者）

研究課題一覧（最新5件）

• • 蛋白質サイズの大規模構造遷移に適用可能な反応座標推定法の開発
  • 2023-2025
  • キーワード: 反応座標, 蛋白質構造変化, 分子動力学シミュレーション, 遷移経路, 機械学習, AlphaFold
  • URL: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K14160

CiNii Articles（最新５件）

• • AlphaFoldによる複数の準安定状態をもつタンパク質の構造予測
  • 著者: 大貫 隼
  • 出版日: 2025/2/22
  • 出版社: 一般社団法人 日本蛋白質科学会
  • ジャーナル名: 蛋白質科学会アーカイブ
  • キーワード: AlphaFold, 構造予測, AI
  • URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1390025639961607424
• • 2P042 MD で観測されたGアクチンのヌクレオチド依存構造状態とFアクチン安定性との関連(01B.蛋白質:構造機能相関,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))
  • 著者: Ohnuki Jun, Takano Mitsunori
  • 出版日: 2013
  • 出版社: 一般社団法人 日本生物物理学会
  • ジャーナル名: 生物物理
  • URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1390282681519513472
• • 26aXZC-11 キネシン-微小管結合におけるループ領域と静電相互作用の寄与(26aXZC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
  • 著者: 水原 志暢, 大貫 隼, 梅澤 公二, 高野 光則
  • 出版日: 2013
  • 出版社: 一般社団法人 日本物理学会
  • ジャーナル名: 日本物理学会講演概要集
  • URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1390282680964065792

CiNii Books（最新５件）

• • 月刊「細胞」2024年4月号 ライフサイエンス分野におけるAI解析「分子シミュレーション×AlphaFold2でトランスポータータンパク質の未解明構造を明らかにする」
  • 著者: 大貫 隼
  • 出版日: 2024
  • 出版社: ニューサイエンス社
  • URL: https://cir.nii.ac.jp/crid/1020584168925999744